2019年云南省全力抓紧抓实生态环境保护工作，圆满完成国家下达的各项目标任务，全省生态环境质量持续改善。
2019年，全省空气环境质量持续保持优良，16个州市政府所在地城市空气质量优良天数比率达98.1%。六大水系出境跨界断面水质100%稳定达标，保持Ⅲ类以上水质。265个国控省控断面水质优良率为84.5%，同比上升0.7个百分点。纳入国家考核的100个地表水断面水质优良比例为78%。九大高原湖泊水质稳中向好，抚仙湖、泸沽湖水质I类，阳宗海、洱海III类，滇池草海、程海IV类，滇池外海、杞麓湖、异龙湖V类，星云湖劣于V类。州市级城市集中式饮用水水源地水质检测达标率为97.9%，县级以上集中式饮用水水源地水质达标率98.9%。
随着污染防治攻坚战的持续推进，2019年云南省蓝天、碧水、净土“三大保卫战”和九大高原湖泊保护治理等“8个标志性战役”取得显著成效。
蓝天保卫战方面，云南省完成13个州市政府所在地城市建成区及周边重污染企业搬迁，累计完成6台装机容量共1800兆瓦火电机组烟气脱硫、脱硝、除尘超低排放改造工程，完成2228家“散乱污”企业综合整治。淘汰注销国Ⅲ排放标准柴油货车2.83万辆，推广新能源车辆14.4万辆，全面供应符合国Ⅵ(B)标准车用汽油、国Ⅵ标准车用柴油，实现机动车遥感监测国家、省、地三级联网。
碧水保卫战方面，云南省以革命性举措抓好九大高原湖泊保护治理，全力推进抚仙湖生态移民搬迁，实施洱海保护治理攻坚战，打响滇池保护治理“三年攻坚”行动，洱海保护治理工作受到生态环境部肯定。扎实开展长江流域劣Ⅴ类国控断面整治等8个专项行动，大力推进六大水系水污染防治、水生态保护。全面完成县级以上集中式饮用水水源地环境问题整治，地级城市建成区33条城市黑臭水体整治消除率为100%。
净土保卫战方面，云南省先后完成全省农用地土壤污染状况详查，稳步推进重点行业企业用地调查，完成31个试点县耕地土壤质量类别划分，推进了23个土壤污染治理与修复技术应用试点项目建设。对涉重金属重点行业、工业固体废物及堆存场所、非正规垃圾堆放点开展大排查，严格危险废物经营许可审查和跨省转移审批，全力推进固体废物污染治理攻坚战。
在扎实推进污染防治攻坚战的同时，全省生态环境保护督察工作进一步深入。截至目前，中央环保督察“回头看”指出的58个问题已经完成整改37个，正在整改21个;13个长江经济带突出生态环境问题完成整改10个，正在整改3个。
2019年以来，全省自然生态环境保护成果丰硕。云南在全国率先发布《云南省外来入侵物种名录(2019版)》，启动编制《云南的生物多样性保护》白皮书。全省生态文明建设示范区创建工作取得显著成效，贡山独龙族怒族自治县被命名为第三批“绿水青山就是金山银山”实践创新基地，盐津县、洱源县、屏边苗族自治县被命名为第三批国家生态文明建设示范县。
